Oprócz relikwii kolegiackich są w Zamościu też w innych kościołach, W kościele św. Krzyża znajduje się Drzewo Krzyża Św. W pozostałych kościołach zamojskich są relikwie: św. Andrzeja Boboli (od 1938 kościół św. Katarzyny - część żebra), św. Teresy z Lisieux (od 2005 kościół św. Katarzyny, przekazali karmelici bosi z Przemyśla), św. Faustyny (od 2004 kościół św. Michała, kościół MB Królowej Polski - partykuły kości), św. Ojca Pio (kościół św. Michała - bandaże przesiąknięte krwią, kościół Zwiastowania), św. Rity (od 22 X 2017 kościół św. Bożej Opatrzności - fragment kości, z Watykanu), bł. Jana Pawła II (od 12 VI 2012 jako jedyny w Polsce szpital z papieskimi relikwiami - w kaplicy kropla krwi na skrawku materiału). Od 19 XI 2014 relikwie św. Jana Pawła II (pukiel włosów) posiada także kaplica w Szpitalu Niepublicznym, a od 4 VII 2020 (fiolkę z krwią) kościół MB Królowej Polski, pomógł je sprowadzić i przekazał abp M. Mokrzycki.
19-20 X 1995 franciszkanie "gościli" relikwie św. Antoniego z Padwy (struny głosowe, kość najbliższa serca), a w 2006 u "św. Katarzyny" bł. ks. S. Frelichowskiego - patrona harcerzy. 8 IX 2013 parafię św. Michała nawiedziła cudowna figura patrona z góry Gargano we Włoszech. W VI 2015 peregrynację po zamojskich kościołach odbyły relikwie bł. ks. Popiełuszki (21 Katedra, 23 św. Krzyża, 27 Królowej Polski).
W X 2012 w zamojskiej cerkwi znalazły się relikwie Romana Miedwieda (osobne hasło).

 * 7 IX 1938 z inicjatywy rektora Staniszewskiego sprowadzono relikwie św. Andrzeja Boboli, tego dnia powitano je, a na noc przeniesiono do kolegiaty, następnie na rynek, skąd po uroczystości z udziałem 30 tys. umieszczono je w prawym ołtarzu kościoła św. Katarzyny, a magistrat 10 XII 1938 plac gimnazjum przemianował na Pl. św. Andrzeja Boboli.
* Uroczystość przekazania kościołowi św. Katarzyny w 2005 relikwii św. Teresy odbyło się w obecności tysiąca wiernych, poświęcono na pamiątkę setki róż, a ucałowali relikwie m.in. senator Chróścikowski i prezydent Zamoyski.