W 2003 zorganizowano turniej o puchar Prezydenta z udziałem gimnazjalnych drużyn, a X – oficjalnie I-szy raz w mieście odbyło się spotkanie piłkarskie (Puchar Polski) "Hetman" wygrał sensacyjnie 2:0 z LUKS Krasnystaw (trener Z. Pająk), a pierwszego gola w 9 min. zdobyła Justyna Antoszek.
Klub z problemami finansowymi nie zgłosił zespołu więc zrobił to 16 VIII 2004 SSA "Hetman Energetyk"  i drużyna zagrała w jednej z 5 grup II ligi (trener P. Lewandowski, piłkarki 14-18 lat, już reprezentacji wojew. Anna Fik, Anna Lepa). Do inauguracji doszło 4 IX 2004. Po jesieni zajmowały 9 miejsce (10 gł. lubelskich zespołów) z 4 pkt i 11:39 bramkami, ostatni mecz, zdekompletowany oddając walkowerem.
Drużyna "Hetmana" Zamość grała przez 4 sezony w II lidze. Debiutowała w I sezonie 2004/2005 - 7 m. (10 - sześć grup) i kolejno 2005/6 - 4 m. (5), 2006/7 - 4 m. (9), 2007/8 - 3 m. (9), te ostatnie rozgrywki kończąc z imponującym bilansem bramek 52:29 i 43:10 (średnia ponad trzy bramki, z Włodawianką 15:0). Obecnie w rozgrywkach III ligi występuje "Gaudium" Zamość (2013/14 - 9 m./10).