Wzniesiony dla Reformatów (osobne hasło) w 1683-86 wg proj. Jana Linka jego autorstwo kwestionowane jest ostatnio), konsekrowany 26 V 1686 przez bpa Święcickiego. Jednonawowy, z 2 dekoracyjnymi szczytami i sygnaturką. Przez wiele lat zaangażowany przy jego budowie był murarz Andrzej Sieczka. Oprócz głównego ołtarza p.w. Krzyża Św. i św. Piotra, były ołtarze boczne Niepokalanego Poczęcia NMP (zach.) i św. Franciszka (wsch.), a później kolejne św. Antoniego, św. Barbary i św. Anny. Posiadał sklepione krypty, w których spoczywał m.in. bp chełmski Jan Szaniawski (zm. 1733) oraz marszałek w. kor., kasztelan krakowski Józef (zm. 1747) z Konstancją Mniszchowie, z kosztownie wystawionym marmurowym nagrobkiem i złotem wyrytym łacińskim epitafium (wyszło drukiem). W 1806 kościół zamknięto, ołtarz trafił do Komarowa (konserwatorzy odkryli datę VIII 1699), obraz ołtarzowy św. Piotra do Kolegiaty. W 1774 powstała ambona, ołtarz św. Barbary, nowe okna, pokryto kościół nową dachówką.
Wnętrze kościoła najpierw podzielono na 2 kondygnacje. Podczas oblężenia w 1813  garnizon urządził w nim młyn na 6 koni z dużym kołem trybowym o 12 ramionach. W 1820 rozpoczęto czyszczenie lochów, w kościele urządzono magazyn (w czasie przebudowy w 1866 prezbiterium podzielono na 3 kondygnacje). Od poł. XIX w. do pocz. XX w. była tu kuchnia garnizonowa, później skład wojskowy (1/2 węgla), od 1915 kino i okazjonalnie teatr 30 p.p. (m.in. dobud. kasę z przedsionkiem, wejście od płn., scena vis a vis ołtarza, proj. Rappe), urządzone z funduszu wdów i sierot po poległych 30 p.p. 3 V 1919 odbyła tu uroczystość z udziałem gen. Hallera. W 1922 m.in. z inicjatywy rzemieślników i robotników w związku chrześcijańskim przekazany kościołowi (osobne hasło: Kościół św. Katarzyny).

 * W 1995 przy płd.-wsch. narożniku odkryto murowany grobowiec, być może o. Wojciecha (Józefa) Męcińskiego, przemawiają za tym napisy na resztkach trumny (inicjał) w tym roku kościół był już jednak budowlą świecką.
 * Na licytacji rzeczy kościelnych i klasztornych konwentu reformatów ogłoszonej przez Urząd cyrkularny i odbytej 21 VIII 1807 sprzedano: ołtarz wielki za 85 reńskich, Ołtarz Najśw. MP 20, cyborium do ołtarza 2, Ołtarz św. Franciszka 22, ołtarz św. Piotra z Alkantary 21, Ołtarz św. Ambrożego 21, Ołtarz św. Anny 31, Ołtarz św. Barbary 35, Cyborium do ołtarza wielkiego 30, Krucyfiks do ołtarza wielkiego 5, Lampa mosiężna sprzed ołtarza 22, 12 antepediów 26, Ambona 21, Ławki kościelne  32, 10 konfesjonałów 492 kropielnice marmurowe i drzwi żel. do zakrystii 31, 71 lichtarzy, 2 nagrobki marmurowe, 2 szafy z szufladami, 21 szaf mniejszych, 19 łóżek, 8 dużych stołów, ogółem 747 reńskich, z tego 565 różnym konwentom.
* Rozmiary kościoła wg inwentaryzacji E. Kranza z 1921 - dł. 36,10, szer. fasady 13,50, szer. prezbiterium 6,80, wewnątrz nawa dł. 21,15, szer. 11,80.