W Zamościu znajdują się trzy cykle witrażowe o rozbudowanym programie teologiczno-artystycznym, w kościele św. Krzyża (Witraże w kościele św. Krzyża), kościele św. Michała i kościele św. Jana Bożego. Witraże w kościele św. Michała są proj. Bolesława Szpechta z Krakowa (1989-92) - w nowej części kościoła sceny z życia Jezusa, w starej części postacie polskich świętych. W 2010 powstały witarże w oknach kopuły i dachu.
* Witraże w nowej części - ściana wschodnia (prezbiterium) Ukrzyżowanie, Duch Święty, Zmartwychwstanie, południowa Przekazanie władzy pasterskiej Piotrowi, Wniebowstąpienie, Zesłanie Ducha Świętego, zachodnia Królowa Polski, Boże Narodzenie, północna Kazanie na Górze, Przemienienie Pańskie, Spotkanie z kobietą cudzołożną, w starej części - ściana północna św. Wojciech, św. Maksymilian Kolbe, Bł. Karolina Kózkówna, św. Andrzej Bobola, południowa św, Stanisław Bp, św. Brat Albert, św. Jadwiga, św. Stanisław Kostka, z 2010 w kopule Ostatnia Wieczerza, Wniebowziecie NMP i Sąd Ostateczny i dachu bł. ks. Jerzy Popiełuszko i Sł. Boży Jan Paweł II.
